MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	A	6	6	20	25	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022608	GCT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022608	TGTT	2	8	45	52	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022608	T	8	8	65	72	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022608	A	6	6	79	84	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022608	GAA	2	6	103	108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022608	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022608	T	6	6	151	156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022608	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022608	A	6	6	163	168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022608	TTTC	2	8	179	186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022608	ACT	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022608	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022608	T	7	7	369	375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022608	TCA	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022608	A	6	6	501	506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022608	A	7	7	561	567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022608	AGG	2	6	575	580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022608	TTAAA	2	10	864	873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022608	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022608	AGGT	2	8	883	890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022608	AAT	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022608	T	7	7	1298	1304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022608	TGAAC	2	10	1325	1334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022608	A	7	7	1366	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022608	GTTT	2	8	1414	1421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022608	GTC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022608	A	7	7	1445	1451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022608	AAT	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022608	A	6	6	1532	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022608	ATTT	2	8	1558	1565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022608	TAA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022608	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022608	TCA	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022608	T	6	6	1712	1717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022608	TA	3	6	1723	1728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022608	A	6	6	1731	1736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022608	GAAAC	2	10	1737	1746	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022608	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022608	TA	3	6	1768	1773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022608	A	7	7	1782	1788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022608	CTT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022608	AGGC	2	8	1822	1829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022608	CGC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022608	TGT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022608	GGT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022608	ACA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022608	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022608	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022608	A	6	6	2309	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022608	A	6	6	2425	2430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022608	AT	3	6	2519	2524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022608	TCA	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022608	A	7	7	3504	3510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022608	AGG	2	6	3577	3582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022608	T	6	6	3583	3588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022608	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022608	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022608	TTA	2	6	3630	3635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022608	A	8	8	3644	3651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022608	AG	3	6	3714	3719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022608	G	6	6	3750	3755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022608	T	7	7	4227	4233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022608	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022608	AT	3	6	5131	5136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022608	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022608	CCT	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_022608	CCT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022608	ATA	2	6	5844	5849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022608	TAT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022608	T	6	6	5865	5870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022608	TA	3	6	5877	5882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022608	AT	3	6	5883	5888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022608	T	6	6	5926	5931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022608	AAT	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022608	TTA	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022608	T	8	8	6025	6032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022608	TA	3	6	6035	6040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022608	TTG	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022608	TAAA	2	8	6065	6072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022608	A	6	6	6070	6075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022608	CTT	2	6	6076	6081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022608	ATG	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022608	TA	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022608	A	8	8	6179	6186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022608	TAAA	2	8	6191	6198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022608	CCTATA	2	12	6732	6743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022608	T	7	7	6750	6756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022608	TAA	2	6	6788	6793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022608	GAGAG	2	10	6817	6826	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022608	AGG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022608	TAT	2	6	7700	7705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022608	TTAC	2	8	7734	7741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022608	ATT	2	6	7788	7793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022608	TAT	2	6	7806	7811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022608	GGA	2	6	7877	7882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022608	T	7	7	8506	8512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022608	TTA	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022608	TAA	2	6	8566	8571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022608	AATT	2	8	8603	8610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022608	ACT	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022608	ACTA	2	8	8981	8988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022608	A	6	6	8988	8993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022608	TCCT	2	8	9259	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022608	TA	3	6	9273	9278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022608	ATT	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022608	T	6	6	9342	9347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022608	T	6	6	9393	9398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022608	CTTA	2	8	9405	9412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022608	CAAAT	2	10	9451	9460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022608	AC	3	6	9475	9480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022608	A	6	6	9484	9489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022608	TG	3	6	9512	9517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022608	T	7	7	9574	9580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022608	GAT	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.